本发明公开了一种基于生物工程制药原料加工设备,属于生物制药技术领域,其包括原料箱,所述原料箱内壁的上表面和下表面均设置有第一轴承,两个所述第一轴承内设置有同一第一转轴。该基于生物工程制药原料加工设备,通过设置滤板、齿杆、第一转轴、第一导向槽、第一导向杆、支撑架、第一滑杆、齿杆、齿轮和连接杆,第一转轴转动的同时可以控制第一导向杆向上移动,此时支撑架控制第一滑杆和齿杆向上移动,此时齿杆控制齿轮和连接杆转动,本装置可以控制连接杆水平转动的同时自身进行旋转,保证对竖直方向上药物原料的充分混合,同时药物原料添加过程较为均匀,可以在一定程度上保证对药物原料的混合效果较为理想。